如何将HDF5数据集定为SnakeMake输入/输出

Question

我如何告诉snakemake规则的输入/输出应该是HDF5数据集(因此，在实际的实际HDF5文件路径中使用其自己的特定"路径"？

Answer 1

snakemake将输入和输出文件路径视为字符串，无论文件类型和内容如何。如果您的HDF5文件具有特定的路径，请在输入/输出指令中使用这些路径，可能会使用功能AS输入来定位HDF5路径。

对于更有用的答案，您应该在问题中添加一些示例代码。