我如何与R中的两个数据相交

Question

我有两个在data.frame结构中的表。表1包含200个基因ID（字母和数字）的列，表2包含4,000个基因ID（行）的列表以及20个其他列。我想与这两个表相交，并生成一个新的表3，该表3包含200个基因ID以及20列中的相关信息。

table3＆lt; - table1％n％table2

Answer 1

您想要

之类的东西

table3 <- merge(table1, table2, by.x="id", by.y="id", all.x=T, all.y=F)

您也许还可以对这样的事情进行子集：

table3 <- table2[table2$id %in% table1$id,]

preprex会使这篇文章更有可能得到良好的回应，但是您应该能够找到一些东西来帮助您进行一些搜索。如果这些不起作用，因为您有一个独特的问题，以前没人问过，请给出一个reprex，我们可以尝试为您提供替代解决方案。

编辑：有关更多上下文，这是我上周回答的类似问题，这是理解合并的精彩文章。

Answer 2

我建议dplyr软件包。我认为，它比merge更直观。

您可以键入：

table3 <- left_join(table1, table2, by = "unique_id")