我想创建一个带有结合了两个函数的 aggfunc 的数据透视表。我试过这个
pivot=pd.pivot_table(data, columns='Genename', values=['Mediancoverage'],index='Componentnr', aggfunc=(np.median - np.std))
并得到此错误:
类型错误:不支持的操作数类型 -:"函数"和 "功能">
我理解问题所在,但解决方案是什么?
我认为你需要lambda
- 带有熊猫函数的解决方案 median
+ std
(ddof=0
是必要的更改,因为默认情况下在熊猫中ddof=1
(:
aggfunc=lambda x: x.median() - x.std(ddof=0)
什么与:
aggfunc=lambda x: np.median(x) - np.std(x)
样本:
data = pd.DataFrame({
'Genename' : ['a','a','b','b', 'b', 'b'],
'Mediancoverage' : [4, 1, 5, 3, 7, 5],
'Componentnr' : [1,2,1,2,1,2],
})
print (data)
Componentnr Genename Mediancoverage
0 1 a 4
1 2 a 1
2 1 b 5
3 2 b 3
4 1 b 7
5 2 b 5
pivot=pd.pivot_table(data,
columns='Genename',
values='Mediancoverage',
index='Componentnr',
aggfunc=lambda x: x.median() - x.std(ddof=0))
print (pivot)
Genename a b
Componentnr
1 4 5
2 1 3
pivot=pd.pivot_table(data,
columns='Genename',
values='Mediancoverage',
index='Componentnr',
aggfunc=lambda x: np.median(x) - np.std(x))
print (pivot)
Genename a b
Componentnr
1 4 5
2 1 3