我刚刚收到了我的第一个纳米孔数据集，并收到了一个fastq文件。我期待一个 fast5 文件，现在我不确定如何开始过滤数据。我遇到的大多数工具(NanoOK，poretools(都处理fast5格式，尽管它们都提供了从fast5转换为fastq的方法，但它们的工具只接受fast5输入。
当我尝试使用该fastq_quality_filter时，我收到堆栈粉碎错误...
通常，Nanopore数据分析的第一步是从fast5转换为fastq，因此它们实际上节省了您的工作。进一步的分析可以在poretools、Porechop或poRe等软件中使用fastq完成。您在fastq_quality_filter中的错误可能还有其他原因。