Python：urllib.request.urlretrieve保存一个空文件。写在里面"Supplied id parameter is empty."

Question

这是我想要下载和保存的文件类型：

http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=562868704,585641505&rettype=fasta&retmode=text

。这是测试代码：

import urllib.request
import xml.etree.ElementTree as ET
mystring = ' '
link = urllib.request.urlopen('http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=protein&db=nuccore&linkname=protein_nuccore_mrna&id=13591999,149050462')
tree = ET.parse(link)
root = tree.getroot()
for branch in root.iter('Link'):
    for something in branch.iter('Id'):
        mystring += something.text + ','
mRNA = urllib.request.urlretrieve('http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=' + mystring + '&rettype=fasta&retmode=text', 'C:/Users/User/Documents/mRNA.fasta')

它创建了文件，但随后为空，我不知道问题是什么。谢谢你的帮助。

Answer 1

生成的 URL 包含一个空格;你自己把它放在那里：

mystring = ' '

如果我用空字符串替换它，您的代码似乎可以正常工作：

mystring = ''

您可以使用列表并使用 str.join() 方法来构建值，而不是使用字符串串联：

elements = []
for element in root.findall('.//Link/Id'):
    elements.append(element.text)
mystring = ','.join(elements)

我将 Element.findall() 方法与 XPath 表达式一起使用，以列出所有匹配的 Id 节点。