如何将rmarkdown报告与shinyapps链接以导出R中的Web应用程序内容



我正在尝试构建一个R中有光泽的Web应用程序,它通过几个表、一个动态图和一个图像来显示不同指标的值。结果就像是列表中所选项目的情况说明书,我想捕捉结果,并提供下载屏幕上显示内容的可能性(表格、图表和图像)。

我看到我可以通过在Rmarkdown中生成一个报告并使用downloadHandler导出它来实现这一点,如下例所示(http://dev.use-r.com/shiny-examples/016-knitr-pdf)。据我所知,在服务器中,输出$downloadReport创建了一个由文件名和内容组成的对象,该对象基于之前存储在与ui相同目录中的报告模板。R和服务器。R据此:

 #Output report
 output$downloadReport <- downloadHandler(
  filename = function() {
   paste(input$City_id,'factsheet', sep = '.', switch(
    input$format, PDF = 'pdf', HTML = 'html', Word = 'docx'
  ))
 },
  content = function(file) {
   src <- normalizePath('report.Rmd')
   return(src)
   # temporarily switch to the temp dir, in case you do not have write
   # permission to the current working directory
   owd <- setwd(tempdir())
   on.exit(setwd(owd))
   file.copy(src, 'report.Rmd')
   library(rmarkdown)
   out <- render('report.Rmd', switch(
     input$format,
     PDF = pdf_document(), HTML = html_document(), Word = word_document()
   ))
   file.rename(out, file)
  }
 )

为了检查本例中报告的模板,我遵循了以下步骤(https://github.com/rstudio/shiny-examples/blob/master/016-knitr-pdf/report.Rmd)。但是,当我想创建我的"report.Rmd"模板时,我发现有不同的方法可以创建新的R标记文档(具有不同输出格式、演示文稿、光泽和模板的文档),并且这种选择会影响输出。我试过其中一些,但没有成功。

例如,我采用了一种新的R Markdown文档html输出格式,名为"report.Rmd",并将其保存在与ui和服务器文件相同的文件夹中。有一些非常简单的内容:

title: "Untitled"
author: "Raquel_ub"
date: "Tuesday, October 27, 2015"
output: html_document
---
# Selected city
```{r, echo=FALSE}
level(input$City_id)
```

我得到了一个非信息性错误: Error opening file: 2 Error reading: 6

任何关于正在发生的事情的暗示/线索都是非常受欢迎的!

非常感谢,Raquel

啊,我的会话信息:

> sessionInfo()
R version 3.1.1 (2014-07-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=Spanish_Spain.1252  LC_CTYPE=Spanish_Spain.1252   
[3] LC_MONETARY=Spanish_Spain.1252 LC_NUMERIC=C                  
[5] LC_TIME=Spanish_Spain.1252    
attached base packages:
[1] splines   stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
other attached packages:
[1] rmarkdown_0.8.1   shiny_0.12.2      rsconnect_0.4.1.7 rCharts_0.4.5    
[5] doBy_4.5-13       survival_2.37-7   foreign_0.8-66   
loaded via a namespace (and not attached):
 [1] digest_0.6.8     evaluate_0.8     formatR_1.2.1    grid_3.1.1      
 [5] htmltools_0.2.6  httpuv_1.3.3     jsonlite_0.9.17  knitr_1.11      
 [9] lattice_0.20-29  magrittr_1.5     MASS_7.3-33      Matrix_1.1-4    
[13] mime_0.4         packrat_0.4.5    plyr_1.8.3       R6_2.1.1        
[17] Rcpp_0.12.1      RJSONIO_1.3-0    rstudio_0.98.977 rstudioapi_0.3.1
[21] stringi_1.0-1    stringr_1.0.0    tools_3.1.1      whisker_0.3-2   
[25] xtable_1.7-4     yaml_2.1.13   

我遇到了类似的情况,也尝试了downloadHandler,但我无法使其工作,所以我所做的是:

  1. 在服务器代码块中,将生成的绘图、data.frame等放入全局环境中,如下所示:plot1<<-ggplot()
  2. save("df.1","plot1", file="path/to/file/MyData.RData")保存这些对象
  3. template.Rmd文件中加载MyData.RData文件:

```{r, echo=FALSE, message=FALSE} load("path/to/file/myData.RData") ```

我认为剩下的很容易弄清楚。

干杯!

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