我想使用一些需要 R 版本 3.4 及更高版本的 R 包。我想通过 rpy2 (2.8( 在 python (3.6.1( 中访问这些包。
我安装了 R 版本 3.4，它位于/Library/Frameworks/R.framework/Resources但是，当我使用pip3 install rpy2安装和使用 python 3.6.1 作为我的解释器时，/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/bin/python3.6)，我收到错误：
回溯(最近一次调用(： 文件 "/Users/vincentliu/PycharmProjects/magic/rpy2tester.py"，第 1 行，在 从 RPY2 导入对象 文件 "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/robjects/init.py"，第 16 行，在 导入 rpy2.r接口作为 rinterface 文件 "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/init.py"，第 92 行，在 从rpy2.rinterface._rinterface导入(baseenv， ImportError： dlopen(/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/_rinterface.cpython-36m-darwin.so， 2(： Library not loaded： @rpath/libiconv.2.dylib 引用自：/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/_rinterface.cpython-36m-darwin.so 原因：不兼容的库版本：_rinterface.cpython-36m-darwin.so 需要版本 8.0.0 或更高版本，但 libiconv.2.dylib 提供版本 7.0.0
这首先似乎是由Anaconda引起的问题，因此我删除了所有与Anaconda相关的文件，但问题仍然存在。
然后我卸载了 rpy2，重新安装了 Anaconda 并使用conda install rpy2进行安装，这也通过 Anaconda 安装了 R 版本 3.3.2。然后我可以将解释器更改为/anaconda/bin/python并且可以很好地使用 rpy2，但我无法使用我关心的 R 包，因为它们需要 R 版本 3.4 及更高版本。显然，Anaconda 可以安装的最旧版本是 3.3.2，那么有什么方法可以将 rpy2 与 R 版本 3.4 一起使用吗？
我可以看到这个问题的两种通用解决方案。一种是通过 conda 安装 rpy2，然后以某种方式将其依赖 R 更改为系统中的 3.4 R。另一种解决方案是解决错误
不兼容的库版本：_rinterface.cpython-36m-darwin.so 需要版本 8.0.0 或更高版本，但 libiconv.2.dylib 提供版本 7.0.0
经过一番挣扎，我都没有发现任何好的结果。
我卸载了 rpy2 并使用--verborse重新安装。然后我发现
libpcre.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libpcre.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/liblzma.dylib，文件是为x86_64构建的，而不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/liblzma.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libbz2.dylib，文件是为x86_64构建的，而不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libbz2.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libz.dylib，文件是为x86_64构建的，而不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libz.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libiconv.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libiconv.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libicuuc.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libicuuc.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libicui18n.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/lib/libicui18n.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/R，文件是为x86_64构建的，它不是正在链接的架构 (i386(：/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/R
所以我认为原因是 libiconv 在opt/local中的架构不兼容，导致 make 在usr/lib年回退到过时的 libiconv 上。这很奇怪，因为我的机器应该在x86_64而不是 i386 上运行。然后我尝试export ARCHFLAGS="-arch x86_64"并使用端口重新安装 libiconv。这解决了问题。
我已经卸载了pip版本并从下载https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/downloads/上的源代码python setup.py install安装。FWIW也根本不使用蟒蛇。