python的问题:未定义的符号:sqmI

Question

我已经在我的 Ubuntu 上安装了这个软件包：pyinteraph.py 安装后，我遇到了这个问题：

File "/home/user/Scrivania/PyInteraph-1.0/test/pyinteraph/pyinteraph", line 162, in <module>
from libinteract import libinteract as li
File "/home/user/Scrivania/PyInteraph-1.0/test/lib/python/libinteract/libinteract.py", line 8, in <module>
from innerloops import LoopDistances
ImportError: /home/user/Scrivania/PyInteraph-1.0/test/lib/python/libinteract/innerloops.so: undefined symbol: sqmI

我不知道如何解决它

Answer 1

我能够通过一些调整在我的机器上安装并使其工作......这绝对不理想，希望软件包维护者可以更新安装说明。

这是我所做的：

1. 为您的项目创建一个新目录，mkdir myproj
2. 将目录更改为新目录cd myproj
3. 创建新的维鲁塔伦夫virtualenv --python=python2.7 venv
4. 激活维鲁塔伦夫source venv/bin/activate
5. pip install numpy scipy matplotlib networkx weave
6. pip install MDAnalysis==0.7.6
7. 克隆 pyinteraph 存储库：git clone https://github.com/ELELAB/pyinteraph.git
8. CD皮因特拉夫
9. Python setup.py 安装
10. (这是它变得有点黑客的地方... 由于 scipy 的这个问题，我们需要编辑 MDAnalysis 文件以导入weave而不是scipy.weave。将文件中的几行venv/lib/python2.7/site-packages/MDAnalysis/analysis/distances.py从：

import numpy
from scipy import sparse
from scipy import weave
from scipy.weave import converters

自

import numpy
from scipy import sparse
#  from scipy import weave
#  from scipy.weave import converters
import weave
from weave import converters

然后要检查它是否正常工作，请打开一个python shell并尝试：

from libinteract import libinteract

如果没有错误，您就可以开始了。

编辑：维护者在这里有一个py3版本