奇怪的迭代结果 "error is nan" 和使用 t-SNE 的运行时警告

Question

我正在使用t-SNE python实现来减少X的维数，该包含100个实例，每个实例由1024个参数描述，用于CNN可视化。

X.形状 = [100， 1024]

X.dtype = float32

当我运行时：

Y = tsne.tsne(X)

第一个警告在 tsne.py 第 23 行中弹出：

运行时警告：日志中遇到的除以零 H = Math.log(sumP( + beta * Math.sum(D * P(/sumP

然后在以下行中还有更多这样的警告：

运行时警告：在除法中遇到无效值

最后，我在处理过程中的每次迭代后都会得到这个结果：

迭代 xyz ：错误是 nan

代码结束时没有"错误"，最后我得到一个空散点图。

编辑：

-> 我已经尝试过使用不同的数据集，并且效果很好。但是，我也需要它在我的第一组(似乎会引起问题的那组(上工作

问题：

有谁知道可能导致这种情况的原因？有解决方法吗？

Answer 1

sumP = sum(P)+np.finfo(np.double).eps
H = np.log(sumP) + beta * np.sum(D * P) / sumP;

这应该可以解决问题