r-根据shapefile映射原始数据和平均数据

Question

sI有这样的数据集（pts）：

x <- seq(-124.25,length=115,by=0.5)    
y <- seq(26.25,length=46,by=0.5)
z = 1:5290
longlat <- expand.grid(x = x, y = y)  # Create an X,Y grid
pts=data.frame(longlat,z) 
names(pts) <- c( "x","y","data")

我知道我可以通过以下操作将数据帧（pts）映射到映射中：

library(sp)
library(rgdal)
library(raster)
library(maps)
coordinates(pts)=~x+y
proj4string(pts)=CRS("+init=epsg:4326") # set it to long, lat
pts = spTransform(pts,CRS(" +init=epsg:4326 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84    +no_defs +towgs84=0,0,0"))
pts <- as(pts, "SpatialPixelsDataFrame")
r = raster(pts)
projection(r) = CRS(" +init=epsg:4326 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs +towgs84=0,0,0")
plot(r)
map("usa",add=T)

现在我想创建一个单独的地图，显示不同地区的pts平均值。我要使用的形状文件来自ftp://ftp.epa.gov/wed/ecoregions/cec_na/NA_CEC_Eco_Level2.zip然而，这是一张北美地图。如何根据这张北美地图创建只显示美国的地图？或者还有其他更好的方法吗？非常感谢。

Answer 1

我认为，仅根据shapefile中的数据来剪切非美国数据是很困难的，因为这些区域不符合政治边界——不过rgeos可以做到这一点。

假设"eco"是rgdal::readOGR或maptools::readShapeSpatial读入的SpatialPolygonsDataFrame，请参阅可用的索引关键数据：

sapply(as.data.frame(eco), function(x) if(!is.numeric(x)) unique(x) else NULL)

如果你只想绘制它，可以先绘制一张只包含美国地区的地图，然后再过度绘制。

library(maps)
map("usa", col = "transparent")

我们看到数据在Lambert方位角等面积：中

proj4string(eco)
[1] " +proj=laea +lat_0=45 +lon_0=-100 +x_0=0 +y_0=0 +a=6370997 +b=6370997 +units=m +no_defs"

所以require（rgdal）eco.laea<-spTransform（eco，CRS（"+proj=longlat+ellpse=WGS84"）绘图（eco.laea，添加=真）

如果你想在原始的Lambert Azimuthal Equal Area中绘制，你需要在该投影中获得边界框，并在此基础上开始绘制，我只是使用现有数据来做一个简单的例子。我很确定数据也可以用rgeos在另一个边界上裁剪，但这取决于你实际想要什么。