Python:在一个循环中以日志的比例绘制错误条,然后保存图像



我有58个文件需要绘制。其中一些是空的(不重要,我已经用if条件跳过了它们)。我需要绘制文件中的数据,使用日志刻度,并带有错误条。最后我想保存这些情节。我在用Python,spyder。我已经写了以下代码:

route='/......./'
L=np.arange (1,59, 1)
for i in range (L.shape[0]):
    I=L[i]
    name_sq= 'Spectra_without_quiescent_'+('{}'.format(I))+'.dat' 
    Q=np.loadtxt(route+name_sq)
    if (len(Q) != 0):
        x=Q[:,1]
        y=Q[:,2]
        z=Q[:,3]
        fig=plt.errorbar(x,y,yerr=z, fmt = 'b')
        fig.set_yscale('log')
        fig.set_xscale('log')
        xlabel='Frequency'
        ylabel='Flux'
        title='Spectrum_'+('{}'.format(I))+'.dat'
        name='Spectrum_without_quiescent_'+('{}'.format(I))+'.pdf'
        fig.savefig(route+name, fig)

然而,当我运行它时,我会得到以下错误:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/spyderlib/widgets/externalshell/sitecustomize.py", line 540, in runfile
    execfile(filename, namespace)
  File "/media/chidiac/My Passport/DOCUMENTS/My_Publications/2-3C273_radio_spectra/Maximum_flux_code.py", line 49, in <module>
    fig.set_yscale('log')
AttributeError: 'ErrorbarContainer' object has no attribute 'set_yscale'

我仍然是Python的初学者,我找不到错误,也找不到如何修复它。非常感谢您的帮助。

这篇文章可能有点旧,但我也遇到了同样的问题,也许这将在未来帮助其他人。

你最初的解决方案实际上几乎是正确的。然而,set_yscale是一种轴的方法,而不是图形。因此,if语句中的代码应该看起来像:

import matplotlib.pyplot as plt
# other stuff you did ..
x=Q[:,1]
y=Q[:,2]
z=Q[:,3]
fig = plt.figure()
ax = plt.axes()
ax.set_xscale("log")
ax.set_yscale("log")
ax.errorbar(x,y,yerr=z, fmt = 'b')
ax.set_xlabel("Frequency")
ax.set_ylabel("Flux")
ax.set_title("Spectrum_{}.dat".format(I))
name="Spectrum_without_quiescent_{}.pdf".format(I)
plt.savefig(route+name)

我还调整了您对format函数的使用。

请注意,您的第二个解决方案并不总是能正常工作。如果你有非常小的值和小的误差条,这些小值的对数会变大(例如log(10^(-6))=-6,因为使用的是以10为底的对数),尽管你的实际误差很小,但你会有巨大的误差条。

长话短说:使用ax.set_*scale。它是安全的。

我的一个朋友帮助我解决了这个问题,如果有人感兴趣,这里有解决方案:

route='/....../'
L=np.arange (1,59, 1)
print L 
for i in range (L.shape[0]):
    I=L[i]
    name_sq= 'Spectra_without_quiescent_'+('{}'.format(I))+'.dat' 
    Q=np.loadtxt(route+name_sq)
    if (len(Q) != 0):
        x=np.log(Q[:,1])
        y=np.log(Q[:,2])
        z=np.log(Q[:,3])
        fig, ax = plt.subplots(facecolor='w', edgecolor='k')
    plt.errorbar(x,y,yerr=z, fmt = 'b')
    plt.ylabel('Flux', size='x-large')
    plt.xlabel('Frequency', size='x-large')
    title='Spectrum_'+('{}'.format(I))+'.dat'
    name='Spectrum_without_quiescent_'+('{}'.format(I))+'.pdf'
    pylab.savefig(route+name)

第一个技巧是,首先获取数据的日志值,然后绘制它们。由于我不知道有任何命令允许我在对数刻度中绘制错误条,我认为这是最好的解决方案。第二个技巧是使用子情节。除此之外,我在一个图中得到了58条曲线,58次。

我希望这个解决方案是有帮助的。

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