如何衡量由分层聚类生成的两个聚类树之间的相似性?

Question

我想在不同的数据集上应用分层聚类方法(即聚集聚类(。我想比较结果的聚类树。有什么解决方案吗？提前谢谢。

Answer 1

有很多方法可以做到这一点。 我建议你看看小插图中的"比较两个树状图"部分：

https://cran.r-project.org/web/packages/dendextend/vignettes/introduction.html#comparing-two-dendrograms

可能最容易使用的就是cor_cophenetic函数。