我编写了一个python脚本，该脚本获取上游结果并将其输出为pml脚本(一系列PyMoL命令(。当我在pymol中运行文件时，某些命令会运行，但命令行返回"无效选择"选择器错误。
例如。该脚本返回文本行，例如：
fetch 3MPF
create 3MPFB63,3MPF and c. B and i. 63-68
remove 3MPF
align 3MPFB63, ref
当脚本在 PyMoL 中运行时，它说：
PyMOL>fetch 3MPF
please wait ...
PyMOL>create 3MPFB63,3MPF and c. B and i. 63-68
Selector-Error: Invalid selection name "3MPF".
( 3MPF and c. B and i. 63-68 )<--
PyMOL>remove 3MPF
Selector-Error: Invalid selection name "3MPF".
( 3MPF )<--
PyMOL>align 3MPFB63, ref
Selector-Error: Invalid selection name "3MPFB63".
3MPFB63<--
但是，当错误中的这些命令单独运行时，即复制和粘贴代码片段create 3MPFB63,3MPF and c. B and i. 63-68命令运行良好，并进行选择并创建对象。
任何帮助将不胜感激。
似乎这个问题的答案是在 fetch 调用中包含 async=0，迫使命令行在执行第二个命令之前等待该命令的返回，即它试图在对象存在之前选择对象。
例如
fetch 3MPF, async=0
create 3MPFB63,3MPF and c. B and i. 63-68
delete 3MPF
align 3MPFB63, ref
现在，这按预期工作。如果自动运行完整的 PML 时出现其他问题中断，将回发。
经典，"一旦你诉诸于询问，你就会弄清楚"的情况。