我试图通过R.
中的" asbio"软件包将被变量值的数据集传递给pairw.kw函数example.df <- data.frame(
species = sample(c("primate", "non-primate"), 50, replace = TRUE),
treated = sample(c("Yes", "No"), 50, replace = TRUE),
gender = sample(c("male", "female"), 50, replace = TRUE),
var1 = rnorm(50, 100, 5)
)
library(dplyr)
library(asbio)
with(example.df, pairw.kw(var1, species, conf=0.95))
此代码有效。但是,
example.df %>%
filter(treated=="No") %>%
{pairw.kw("var1", "species",conf = 0.95)}
给我错误消息
dim(robj)&lt; - c(dx,dy)中的错误: DIMS [产品0]不匹配对象的长度[1]
我不理解是什么原因导致了这一点,除了假设要比较的两个向量在应用过滤器后变为不同的长度。
除了将数据明确子集以新的数据框架为单位外,是否有其他方法可以解决此问题?我知道这会起作用,但想知道是否存在更优雅的解决方案。
首先,所有 %>%
管道将数据传递到 pairw.kw
函数作为第一个参数。其次,pairw.kw
函数希望两个向量作为输入。您可以使用magrittr
软件包的%$%
管道实现此目标。它的工作类似于with
功能。
library(magrittr)
example.df %>%
filter(treated=="No") %$%
pairw.kw(var1, species, conf = 0.95)
评论中的问题答案:
library(tidyverse)
library(magrittr)
library(asbio)
example.df %>%
group_by(treated) %>%
nest() %>%
mutate(
kw = map(
data,
~ .x %$% pairw.kw(var1, species, conf = 0.95)
),
p_val = map_dbl(kw, ~ .x$summary$`Adj. P-value`)
)