r语言 - 使用权重向量设置 networkD3 节点大小

Question

我正在尝试在 R 中使用 data.tree 和 NetworkD3 来创建文件系统的树表示形式，其中图形的节点按文件大小加权。

library(data.tree)
library(networkD3)
repo <- Node$new("Repository")
git <- repo$AddChild(".git")
prod <- repo$AddChild("Production")
exp <- repo$AddChild("Experimental")
repo$size <- 866000
git$size <- 661000
prod$size <- 153000
exp$size <- 48000

我可以使用 Get 获取这些大小的向量，以便

sizes <- repo$Get("size")

但是当我尝试将它们放在一起时，我不确定如何在网络可视化步骤中包含这些权重信息。尝试做这样的事情...

reponet <- ToDataFrameNetwork(repo,"repo")
net <- forceNetwork(reponet, Nodesize = repo$Get("size"))

无济于事。基本上，我正在尝试做Julia Silge在这篇伟大的SO博客文章中所做的工作。有谁知道如何设置这个？

Answer 1

检查帮助文件以了解forceNetwork...有许多必需的参数尚未设置。

您可以使用simpleNetwork像您一样仅使用链接数据框绘制网络，但它不允许您控制节点大小...例如。。。

simpleNetwork(reponet)

要控制节点大小，您需要使用 forceNetwork ，但它需要链接数据框和节点数据框。您可以从创建的sizes对象构建节点数据框，然后调整链接数据框中的源和目标 ID，以匹配节点数据框中相应节点的索引（0 索引，因为它已发送到 JavaScript）...例如。。。

nodesdf <- data.frame(name = names(sizes), nodesize = sizes / 10000, group = 1)
reponet$from <- match(reponet$from, nodesdf$name) - 1
reponet$to <- match(reponet$to, nodesdf$name) - 1
forceNetwork(reponet, Nodes = nodesdf, Source = "from", Target = "to", 
             NodeID = "name", Group = "group", Nodesize = "nodesize")