r语言 - ROracle 软件包安装失败



我知道有关此问题的其他问题,但它们与我的系统设置或我遇到的安装错误没有太多共同之处,因此:

我正在使用 Windows 7,64 位

我已经安装了64位Oracle Instant Client 18.3.0.0.0及其sdk和odbc扩展,可从 http://www.oracle.com/technetwork/topics/winx64soft-089540.html

我已将安装位置C:Oracleinstantclient_18_3放在PATH上。

我已经安装了 R 3.5.1 和 Rtools 3.5;两者都在PATH上。

在 R 中,

Sys.setenv(
'ORACLE_HOME' = 'C:/Oracle/instantclient_18_3',
'OCI_INC'     = 'C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include',
'OCI_LIB64'   = 'C:/Oracle/instantclient_18_3'
)
install.packages("ROracle", type="source")

结果如下

* installing *source* package 'ROracle' ...
** package 'ROracle' successfully unpacked and MD5 sums checked
Oracle Client Shared Library 64-bit - 18.3.0.0.0 Operating in Instant Client mode.
found Oracle Client C:/Oracle/instantclient_18_3
found Oracle Client include C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include
copying from C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include
** libs
c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/Program Files/R/R-3.5.1/include" -DNDEBUG -I./oci         -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=generic -c rodbi.c -o rodbi.o
In file included from rooci.h:75:0,
from rodbi.c:181:
./oci/oci.h:716:20: fatal error: ociver.h: No such file or directory
#include <ociver.h>
^
compilation terminated.
make: *** [C:/Program Files/R/R-3.5.1/etc/x64/Makeconf:208: rodbi.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'ROracle'
* removing 'C:/Users/obrienle/Documents/R/win-library/3.5/ROracle'
In R CMD INSTALL
Warning in install.packages :
installation of package ‘ROracle’ had non-zero exit status

Rtools找不到的文件ociver.h肯定存在于OCI_INC文件夹中,所以我不知道为什么会发生这种情况。有人对尝试什么有任何想法吗?

我遇到了完全相同的问题:

c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/include" -DNDEBUG -I./oci         -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=generic -c rodbi.c -o rodbi.o
In file included from rooci.h:75:0,
from rodbi.c:181:
./oci/oci.h:716:20: fatal error: ociver.h: No such file or directory
#include <ociver.h>
^
compilation terminated.

一旦我更接近错误,我意识到发生了什么。在我看来,Rtools 的参数是将 -I 设置为 R 的包含文件夹,而不是 OCI 包含文件夹,猜猜 R 的包含文件夹中没有什么?没错,是奥西弗。我相信 R 尝试将 OCI 包含文件夹的内容复制到 R 包含文件夹,因为这一行距离错误只有几行:

copying from C:Oracleinstantclient_18_3sdkinclude

失败了,也许以管理员身份运行会有所帮助?或者也许编辑文件夹权限?

无论如何,我手动将oracle包含文件夹的内容复制到R包含文件夹,这似乎为我解决了问题。

感谢埃里克的回答,它绝对有效!但问题似乎出在包本身,而不是 R 试图将包含文件复制到 R 的包含文件夹中。所以另一种解决方法是

  • 解压缩源存档,ROracle以便在您的 当前目录
  • 编辑文件ROracle/configure.win并将以下行添加到文件末尾

    cp ${ROCI_INC}/ociver.h ./src/oci

  • 保存并关闭文件。现在在当前目录中对更新的包文件夹运行安装命令

    R CMD INSTALL ROracle

这应该可以解决问题。我不确定开发人员是否忘记在 configure.win 中包含该行,或者这仅适用于较新版本的 R,因为该软件包自 2016 年以来就没有更新过,并且在文档中他们提到 ROracle 支持 R 版本最高 3.2。

我使用4.02。我发现Oracle网站上最新的ROracle软件包可以与InstantClient和上述Sys.setenv设置配合使用。

感谢您的后续米尔科霍斯罗。

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