r语言 - 未使用的参数 - 更正?

Question

我是这方面的新手。我想使用 corrplot 创建一个相关矩阵，并使用以下代码：

cor.mtest <- function(mat, ...) {
mat <- as.matrix(mat)
n <- ncol(mat)
p.mat<- matrix(NA, n, n)
diag(p.mat) <- 0
for (i in 1:(n - 1)) {
for (j in (i + 1):n) {
tmp <- cor.test(mat[, i], mat[, j], ...)
p.mat[i, j] <- p.mat[j, i] <- tmp$p.value
}
}
colnames(p.mat) <- rownames(p.mat) <- colnames(mat)
p.mat
}
p.mat<-cor.mtest(dataset)
corrplot(cor(dataset, use="complete.obs"), type="upper", order="hclust", 
p.mat=p.mat, sig.level=0.1)

这是我以前使用过的，但这次我收到一条错误消息：

Error in corrplot(cor(dataset, use = "complete.obs"), type = "upper",  : 
unused arguments (type = "upper", order = "hclust", p.mat = p.mat, sig.level = 0.01)

知道为什么会这样以及如何解决它吗？

Answer 1

R中的unused argument错误意味着您提供的命名参数与函数的实际参数不匹配。这通常是由拼写错误或意外使用不同包中名称相似的函数引起的。

看起来在这种情况下标记的参数是针对corrplot包的corrplot函数的。还有其他软件包中的corrplot功能，例如arm.您确定加载了正确的包裹吗？

Answer 2

library(corrplot)
dat = read.csv('yourdata')
M<- cor(t(dat[,-1]), use="complete.obs", method="pearson")
corr <- round(cor(M),1)
corrplot(corr , method = "color",is.corr = FALSE
,order = "hclust",hclust.method = c("complete"))