通过 cygwin 命令安装床工具时出错:致命错误:zlib.h:没有这样的文件或目录



我正在尝试通过Cygwin安装bedtools v2.27.0。以下是我尝试过的命令:

$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.27.0/bedtools-2.27.0.tar.gz
$ tar -zxvf bedtools-2.27.0.tar.gz
$ cd bedtools2
$ make

运行最后一个命令时,出现以下错误:

*fatal error: zlib.h: No such file or directory  
*#include <zlib.h>*  
^  
compilation terminated.  
make[1]: *** [Makefile:37: ../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1  
make: *** [Makefile:187: src/utils/FileRecordTools] Error 2*  

我尝试使用以下命令下载libz包:

$ apt-cyg install libz-dev

但它没有用。我收到以下错误:

Unable to locate package libz-dev

请注意,我在Windows(64位机器(上使用Cygwin终端。非常感谢您的帮助。

要安装软件包,请使用 cygwin setup ,或者至少在使用apt-cyg之前找到正确的软件包名称

要查找包含 zlib.h 标头的包,请执行以下操作:

$ cygcheck -p include/zlib.h
Found 10 matches for include/zlib.h
...
zlib-devel-1.2.11-1 - zlib-devel: gzip de/compression library (development)
..

所以你需要安装zlib-devel

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