HDF5可变长度结构,可变长度(C API)



我想将STL容器中包含的数据写入HDF5文件。根据我收集的信息,我需要声明一个连续的内存块,并使用"hdf5.h"Cneneneba API将数据从内存缓冲区传输到磁盘。

对于常规数据空间,过程很简单;只需要在具有CCD_ 2的堆栈上创建临时阵列。HDF5"理解"这样的内存布局。当处理不规则的数据空间时,情况就不同了,因为必须使用专用类型hvl_t

以下代码段有效,但不是ISO C++(11):

// Test data
std::vector< std::vector<int> > jagged_array(3);
jagged_array[0] = {0};
jagged_array[1] = {0, 1, 2, 3};
jagged_array[2] = {0, 1, 2};
hvl_t X[jagged_array.size()];
for (unsigned int i = 0; i < jagged_array.size(); ++i) {
    X[i].len = jagged_array[i].size();
    int * ptr = (int *) malloc (X[i].len * sizeof(int));
    for (unsigned int j = 0; j < X[i].len; ++j) {
        ptr[j] = jagged_array[i][j];
    }
    X[i].p = (void *) ptr;
}

我的C非常生疏;这个片段几乎完全是从HDF5示例页面上撕下来的,除了非法的行hvl_t X[jagged_array.size()];

我应该如何声明一个大小在运行时确定的hvl_t?它肯定涉及malloc,但我在这里真的很困惑。

我知道已经有一段时间了,但我今天遇到了这个问题。这里有一个合适的c++解决方案,不分配额外的内存,只存储指向vlen_t:中向量的指针

// Test data
std::vector< std::vector<int> > jagged_array(3);
jagged_array[0] = {0};
jagged_array[1] = {0, 1, 2, 3};
jagged_array[2] = {0, 1, 2};
hvl_t X[jagged_array.size()];
for (unsigned int i = 0; i < jagged_array.size(); ++i) {
    X[i].len = jagged_array[i].size();
    X[i].p = (void*) &jagged_array[i].front();
}

@Lashane在评论中回答:

应该简单地使用

hvl_t * X = (hvl_t *)malloc(jagged_array.size() * sizeof(hvl_t))

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