我当前正在遇到一个打ic,我正在尝试从某些上游计算中创建值表。通常,我一直以为每次创建这些数据帧时至少有1个值。但是我遇到了一个不是这种情况的例子,最终得到了这样的表格:
df <- data.frame(
Experiment_Batch = c(rep("008_1", 83),
rep("008_6", 82),
rep("520_0", 2),
rep("944_10", 84),
rep("944_8", 85),
rep("944_9", 72)),
Overall = rep(0, 408)
)
这引起了以下下游处理:
df %>%
dplyr::count(Experiment_Batch, Overall) %>%
tidyr::spread(Overall, n, fill = 0) %>%
dplyr::select(Experiment_Batch, `1`)
出错:Error in overscope_eval_next(overscope, expr) : object '1' not found
。
我已经尝试使用tryCatch()
和exists()
,但是我似乎无法使它们正常工作。理想情况下,所有这些都可以使用管道操作员优雅地处理。我已经知道我可以创建一个对象,并根据需要在工作流程中添加一些if-else语句,但是我想知道是否有……"更有趣"的方法来照顾这个问题,所以我不会必须分解工作。
如果您不存在列,则可以使用选择助手功能,如果要忽略选择;在这里,matches("^1$")
将尝试选择其名称与1
完全匹配的列,由于数据框没有列,因此它只是忽略了选择,因为matches
返回integer(0)
:
library(tidyverse)
df %>%
count(Experiment_Batch, Overall) %>%
spread(Overall, n, fill = 0) %>%
select(Experiment_Batch, matches("^1$"))
# A tibble: 6 x 1
# Experiment_Batch
#* <fctr>
#1 008_1
#2 008_6
#3 520_0
#4 944_10
#5 944_8
#6 944_9
matches
返回 integer(0)
当列名称与 select
中被忽略的模式匹配时:
matches("^1$", vars = c("0", "experiment"))
# integer(0)
matches("^1$", vars = c("0", "experiment", "1"))
# [1] 3
如果您需要自定义错误捕获:
library(tidyverse)
df %>%
count(Experiment_Batch, Overall) %>%
spread(Overall, n, fill = 0) %>%
{
tryCatch(
select(., Experiment_Batch, `1`),
error=function(e) select(., Experiment_Batch)
)
}
# replace the error with the customized function to handle the exception
# A tibble: 6 x 1
# Experiment_Batch
#* <fctr>
#1 008_1
#2 008_6
#3 520_0
#4 944_10
#5 944_8
6 944_9