无法在 IBM Watson Studio R 环境笔记本上安装 CRAN 软件包"viridis" "Hmisc"

Question

我正在尝试在IBM Watson Studio上的R环境笔记本中安装CRAN Hmisc软件包。但它反复失败并出现以下错误：

install.packages('Hmisc')
also installing the dependencies ‘checkmate’, ‘rstudioapi’, ‘Formula’, ‘latticeExtra’, ‘acepack’, ‘gridExtra’, ‘htmlTable’, ‘viridis’
Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘Hmisc’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

我尝试单独安装 viridis 包，但也失败并出现相同的错误：

install.packages('viridis')
Warning message in install.packages("viridis"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

Answer 1

我所做的是使用 devtools 访问库的一个版本：

require(devtools)
install_version('Hmisc',  version = "4.1-0")

然后我再次安装了它：

install.package('Hmisc')

然后，您可以加载库library('Hmisc')并运行sessionInfo()以查看您运行的是最新版本。这是一种解决方法，我不知道为什么它最初不想安装。也许它与使用版本 3.3.2 的 DSX 中的 R 有关，并且缺少一些库？我一点头绪都没有。

Answer 2

事实证明是对viridis的不正确的依赖管理。它对viridisLite >= 0.2.0有依赖关系。最新的viridis期待一个名为 cividis 的对象，该对象仅在最新版本的 viridisLite > 0.2.0 上添加。DSX 已安装viridisLite==0.2.0。因此，viridis的安装失败。因此，基本上，显式安装较新版本的viridisLite可以解决此问题。

install.packages(c('viridisLite', 'Hmisc'))

TL;DR - 安装最新的viridisLite，然后安装Hmisc