我不得不在git repo上应用一个过滤分支，出于某种原因，似乎与旧哈希进行了合并，这导致每个文件的树看起来如下：
-. .--A--B--C-....-X--Y--Z
--A'-B'-C'-...-X'
带有素数的提交字母是相应字母的副本，只是使用了不同的SHA1哈希。在应用过滤器分支后出现了提交，这使得很难重做过滤器分支（图中的Y、Z），所以我的问题是，有没有办法删除重复的提交？
编辑：更新了树布局，注意到这两条路径并没有真正共享一个共同的祖先。
您应该将一个分支指向提交Z，并删除指向A'到X'中任何一个的任何分支/标记。然后，提交对象A'到X'从任何引用（如分支和标记）变得不可访问，但只能访问reflog。CCD_ 7有失效时间。默认情况下，在reflog过期90天后，它们将成为真正无法访问的对象。git gc将自动删除这些无法访问的对象。你不需要关心它，因为git会自动处理它。
PS。所有这些行为实际上都是可配置的。提到http://git-scm.com/docs/git-gc详细信息。
[Update]以下是删除无法访问的提交对象的步骤。
查看仅由reflog引用的提交对象A'到X'。
git fsck --unreachable --no-reflogs
然后您可以使用git reflog expire来删除相关的reflog，并使它们真正不可访问。
git reflog expire --expire-unreachable=now --all
现在，您可以使用以下命令显示无法访问的对象。
git fsck --unreachable
要删除这些无法访问的对象，只需运行git prune。
git prune
您还可以使用git gc来删除这些无法访问的对象。它将同时打包对象。
git gc --prune=now
使用当前设置，将分支放置到Z。不要在a'、B'、C'、，。。X’提交。
Git会处理剩下的。
Gitting快乐！
我在您的图中没有看到合并。
运行filter分支时，git将自动将其处理的所有ref复制到refs/original/中。在git gc将核处理原始提交之前，您需要删除所有这些refs并使reflog过期。