如何在C 中读取DICOM像素

Question

我想解析DICOM文件以进行一些像素处理。我尝试了DCMTK库，但对我不起作用。我想要一些非常简单的东西，例如C 中的轻量级跨平台库，因为我只想阅读DICOM文件。

任何建议都将不胜感激。

Answer 1

您可以使用ImageMagick读取DICOM文件，并且它是免费的跨平台，通常安装在Linux发行版上，可用于OSX和Windows。

。

版本6.x的示例遵循...

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// sample.cpp
// Mark Setchell
//
// ImageMagick Magick++ sample code
//
// Compile with:
// g++ sample.cpp -o sample $(Magick++-config --cppflags --cxxflags --ldflags --libs)
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
#include <Magick++.h> 
#include <iostream> 
using namespace std; 
using namespace Magick; 
int main(int argc,char **argv) 
{ 
   // Initialise ImageMagick library
   InitializeMagick(*argv);
   // Create Image object and read in DICOM image
   Image image("sample.dcm"); 
   // Get dimensions
   int w = image.columns();
   int h = image.rows();
   cout << "Dimensions: " << w << "x" << h << endl;
   PixelPacket *pixels = image.getPixels(0, 0, w, h);
   for(int y=0; y<h; y++){
      for(int x=0; x<w; x++){
         Color color = pixels[w * y + x];
         cout << x << "," << y << ":" << color.redQuantum() << "/" << color.greenQuantum() << "/" << color.blueQuantum() << endl;
      }
   }
}

样本输出

Dimensions: 512x512
0,0:0/0/0
1,0:0/0/0
2,0:0/0/0
3,0:0/0/0
4,0:0/0/0
5,0:0/0/0
6,0:0/0/0
7,0:0/0/0
8,0:0/0/0
9,0:0/0/0
10,0:0/0/0
11,0:0/0/0
12,0:0/0/0
13,0:0/0/0
14,0:0/0/0
15,0:0/0/0
16,0:0/0/0
17,0:0/0/0
18,0:0/0/0
19,0:0/0/0
20,0:0/0/0
21,0:0/0/0
22,0:0/0/0
23,0:0/0/0
24,0:0/0/0
25,0:0/0/0
...
...
260,18:80/80/80
261,18:144/144/144
262,18:192/192/192
263,18:80/80/80
264,18:32/32/32
265,18:144/144/144
...
...

如果要使用7.x版本，请参见Eric的技术。

或，在终端的命令行中，您可以将文件转换为原始的8位RGB二进制数据：

# Convert 512x512 image to 8-bit RGB binary file
convert sample.dcm -depth 8 rgb:image.bin
ls -l image.bin
-rw-r--r--    1 mark  staff    786432 30 Jun 15:29 image.bin

您可以希望从文件大小中看到图像现在为786,432字节，这是512x512像素中的每个字节的3个字节，因此您可以直接将数据直接读取到C 程序中，知道您会得到：

>

RGB RGB RGB RGB ... RGB

或，在终端的命令行中，您可以将图像数据转储为十六进制：

convert sample.dcm -depth 8 txt: | more

样本输出

# ImageMagick pixel enumeration: 512,512,65535,gray
0,0: (0,0,0)  #000000  gray(0)
1,0: (0,0,0)  #000000  gray(0)
2,0: (0,0,0)  #000000  gray(0)