据我所知，数据存储是基于bigtable实现的，事务仅支持单个实体组或最多5个跨实体组，但恕我直言bigtable仅支持单行事务，同一实体组中的实体将入多行，数据存储实体组如何在bigtable的限制下存档全有或全无事务。
下一代数据存储（称为 Firestore）使用类似于 Spanner 的体系结构，利用类似的技术来实现多行事务。
更多信息在这里和这里。
有点过时，但 http://googleappengine.blogspot.com/2009/09/migration-to-better-datastore.html 可能会提供一些答案。有关于Megastore的更多详细信息 http://www.cidrdb.org/cidr2011/Papers/CIDR11_Paper32.pdf