r语言 - 如何使用 for 循环从数千个 ncdf 文件填充数据帧

Question

我正在尝试打开数千个netcdf文件并将数据拉入可以另存为csv文件的数据帧中。

因此，将所有 ncdf 文件名作为列表放入 csv 文件后，我最终使用此代码创建了一个数据帧，其中填充了来自 ncdf 文件的数据。

vec0 <- vector()
time <- c(vec0,1:28413)
vec1 <- vector()
temp <- c(vec1,1:28413)
vec2 <- vector()
sphum <- c(vec2,1:28413)
vec3 <- vector() 
rain <- c(vec3,1:28413)
vec4 <- vector()
totprcp <- c(vec4,1:28413)
for (i in 1:length(filenames))
  {ncdata=nc_open(filenames[i]) 
 nctime=ncvar_get(ncdata,"time") 
  time[i] = nctime[1]
nctemp=ncvar_get(ncdata,"Tair_f_inst") 
  temp[i] = nctemp[1]
 nchum=ncvar_get(ncdata,"Qair_f_inst")
  sphum[i] = nchum[1]
  ncrain=ncvar_get(ncdata,"Rainf_tavg") 
  rain[i] = ncrain[1]
  ncprcp=ncvar_get(ncdata,"Rainf_f_tavg")
  totprcp[i] = ncprcp[1]
  nc_close(filenames[i])}
  cbind(time,temp,sphum,rain,totprcp)

但我只获得了第一行的准确数据，并为其余行填充了数字序列（1 到 28412）。我认为我的错误在于我编写代码nc_close组件的方式。有什么想法吗？

Answer 1

nc_close()应应用于 nc 对象本身，而不是文件名。 即"类 ncdf4 的对象（由函数 nc_open 或函数 nc_create 返回）。

所以，你应该使用

nc_close(ncdata)