我使用git已经有一段时间了，但最近才开始使用packrat。我希望我的存储库是独立的，但同时我不想包含CRAN包，因为它们是可用的。似乎一旦在使用packrat的项目中打开R，它就会尝试使用项目库中的包；如果它们不可用，那么它将尝试从项目库中的src进行安装；如果它们不可用，它将查看安装在该计算机中的库。如果计算机中没有可用的库；接下来会看CRAN吗？
我的git repo中至少应该包含哪些文件（例如，packrat.lock）？
您可以选择设置一个类似CRAN的外部存储库，其中包含您希望项目可用的包及其版本的源tarball。然而，默认的行为是接下来查看CRAN，正如您在问题中所指出的那样。查看packrat.lock文件，您会发现，对于您在packrat中使用的每个包，都有一个名为source: CRAN的选项（如果您从CRAN下载了该文件）。
当您有一个本地存储的包源文件时，所述包的锁定内容将更改为以下内容：
Package: FooPackage
Source: source
Version: 0.4-4
Hash: 44foo4036fb68e9foo9027048d28
SourcePath: /Users/MyName/Documents/code/myrepo/RNetica
我有点不清楚你的最后一个问题：What files should I include in my git repo as a minimum (e.g., packrat.lock)?，但我将把它视为a）packrat应该运行哪些文件的组合，以及b）这些文件中的哪些应该提交给git repo。为了回答第一个问题，我在现有的R项目上初始化packrat。
当您运行packrat::init()时，会发生两件重要的事情（以及其他事情）：1.所有的packrat脚手架，包括源tarball等，都是在PackageName/packrat/下创建的。2.packrat/lib*/已添加到您的.gitignore文件中。
因此，我们可以看到packrat/lib*/下的任何东西都不需要提交到您的git repo。这将留下以下3个文件需要提交：
packrat/init.Rpackrat/packrat.lockpackrat/packrat.opts
CCD_ 11是通过版本控制系统与他人协作所必需的；它有助于保持你的私人图书馆的同步。packrat.opts允许您为packrat指定不同的项目特定选项。该文件是使用get_opts和set_opts自动生成的。将此文件提交到git repo将确保为所有合作者维护您指定的任何选项。要提交到回购的最后一个文件是.Rprofile。此文件告诉R使用专用包库（当R从项目目录启动时）。
根据您的需要，您可以选择将源tar球提交到存储库，也可以不提交。如果你不希望它们在git repo中可用，你只需将packrat/src/添加到.gitignore中即可。但是，这意味着任何访问git repo的人都无法访问包源代码，文件将从CRAN下载，或者从packrat.lock文件中源代码行指定的任何位置下载。
根据您的问题，您可能需要将packrat/src/文件夹内容提交给您的repo。