我需要有不同的.flowconfig文件，因为在其中一个文件中我需要在模块部分包含module.file_ext=.web.js，而在另一个文件中我需要包含module.file_ext=.native.js。
这很有用，因为流可以理解路由，并将帮助我确定应用程序是否需要缺少文件。
我正在查看文档，但找不到是否可能。
你是对的，不可能通过 CLI 覆盖它。
.flowconfig似乎是硬编码的：GitHub上的源参考
github上还有一个针对您的问题的未决问题