r语言 - 安装 'ReporteRs' 和 'ReporteRsjars' 时出错



最终,我试图在Windows 7系统上安装R包ReporteRs (ReporteRs_0.8.7.tar.gz)(会话信息,以及下面的其他信息)。这取决于软件包ReporteRsjars (ReporteRsjars_0.0.2.tar.gz),这是我得到安装错误的地方。

这也取决于已安装的R包rJava,以及JDK/JRE (jre1.8.0_112)。

我正在一台没有互联网访问的机器上安装,所以我正在使用PACKAGESPACKAGES.gz构建的CRAN本地版本进行此操作。这已经工作没有任何问题(至少现在是)。

rJava加载没有任何问题,但当安装ReporteRsjars时,我得到下面的错误(见Install Attempt error 下面)。

注意:其他StackOverflow问题似乎更集中在library(rJava)有问题,而不是在安装依赖于rJava的包时。

rJava DLL在以下位置:

C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/rJava/libs/x64/rJava.dll

已重新安装多次(成功)。

sessionInfo和更多的信息是在错误的下面(包括我尝试过的)。

Install Attempt ERROR

cran_dir_url设置为CRAN包所在的路径。前缀为file://

> library(rJava)
> install.packages('ReporteRsjars', contriburl=cran_dir_url, repos = cran_dir_url, type = 'source')
## * installing *source* package 'ReporteRsjars' ...
## ** package 'ReporteRsjars' successfully unpacked and MD5 sums checked
## ** R
## ** inst
## ** preparing package for lazy loading
## ** help
## No man pages found in package  'ReporteRsjars' 
## *** installing help indices
## ** building package indices
## ** testing if installed package can be loaded
## *** arch - i386
## Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
##   call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
##   error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
## Error: loading failed
## Execution halted
## *** arch - x64
## ERROR: loading failed for 'i386'
## * removing 'C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/ReporteRsjars'
## Warning in install.packages :
##   running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:Program FilesRR-3.3.2library" /Users/cirina_ext/Documents/StevenBanville/CRAN_Targeted/ReporteRsjars_0.0.2.tar.gz' had status 1
## Warning in install.packages :
##   installation of package 'ReporteRsjars' had non-zero exit status
## 

环境信息&

Path Info:下面包含在系统路径中,是Java的安装位置。

C:Program FilesJavajre1.8.0_112bin;C:Program FilesJavajre1.8.0_112binserver;%path%

(JDK Installer: JDK -8u112-windows-x64)

Rtools版本和位置

版本:3.4.0.1962位置:C:Rtools

What I Tried

  • 我开始尝试安装ReporteRs R包,这安装了所有依赖项,但在ReporteRsjars包上失败。

  • 在安装了JDK/JRE之后,我重新安装了rJava(这是在各种尝试安装R包之后做的几次)。所有的rJava安装都成功了,library(rJava)也是如此。

  • 我试图在windows命令窗口中运行以下命令,因为我在许多SO答案中看到了这一建议。

    R CMD javareconf

    'javareconf'不被识别为内部或外部命令,可操作的程序或批处理文件。

  • 我试图在path系统变量中包含rJava DLL的路径,但这不起作用。

  • 注意:我在每次尝试后重新启动了RGui和RStudio(我在这两个环境中都尝试过)。我还重新启动了机器。

  • 我已经做了很多谷歌搜索和看着StackOverflow,但所有的问题都发现不一样。它们看起来很相似,但在尝试了一些事情之后,我仍然得到上述错误。我已经省略了我看的链接,但如果有帮助的话,可以添加它们。

如果您能指导我排除故障并解决这个问题,我将不胜感激。

会话信息

> sessionInfo('rJava')
## R version 3.3.2 (2016-10-31)
## Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
## Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
## 
## locale:
## [1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
## [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
## [5] LC_TIME=English_United States.1252    
## 
## attached base packages:
## character(0)
## 
## other attached packages:
## [1] rJava_0.9-8
## 
## loaded via a namespace (and not attached):
## [1] graphics_3.3.2  tools_3.3.2     utils_3.3.2     grDevices_3.3.2 stats_3.3.2     datasets_3.3.2 
## [7] methods_3.3.2   base_3.3.2     

编辑

我尝试在另一台机器上安装64位版本的Java(并确认它是64位),并得到相同的错误。下面是一个代码片段,但它与上面的错误相同:

...
*** arch - i386
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
  error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
Error: loading failed
Execution halted
...

我仍然在看@42-评论中的链接,但这看起来不像是JRE/JDK不是64位的问题。

编辑2

注意:这不是作为一个答案张贴,因为它只是一个解决方案。

我找到了一个不太理想的解决方法。似乎本地CRAN副本的安装并不像我预期的那样相似。我使用非本地CRAN(即通常的方式)在等效的Windows 7机器上安装了有问题的库安装,并将目录复制到另一台机器(即未连接到互联网的机器)。这似乎已经工作,但不清楚为什么其他方法没有(本地CRAN复制与更新包文件)。我注意到的一件事是,当访问通常的CRAN存储库时,它使用.zip版本的库而不是tar.gz;我不确定这是否重要。

编辑3

根据David Gohel在这个记者问题中的回应,下面添加了INSTALL_opts = "--no-multiarch"的代码可能会解决这个问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source', INSTALL_opts = "--no-multiarch")

如果我确定它会解决问题,我会将此添加为答案,但是,我已经实现了EDIT 2中提到的解决方案。

根据David Gohel在此GitHub记者问题中的响应,添加了以下INSTALL_opts = "--no-multiarch"代码,修复了我遇到的问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source',
                 INSTALL_opts = "--no-multiarch")

编辑

变量cran_dir_url应该指向包含.tar.gz安装包文件的目录。可以使用的两个路径示例如下:

# (*) Web: URL pointing to CRAN
cran_dir_url <- "https://cloud.r-project.org/src/contrib"
# (*) Local: Pointing to local copy of CRAN (or whatever local packages you
# would like to install).
# Note: this example is a Mac OS path with username "someuser".
# Note: the three "/" chars are correct ("file://" followed by "/Users/..." => "file:///Users/..."
cran_dir_url <- "file:///Users/someuser/CRAN_Local/"

在上述两个路径(http和file)中,将有.tar.gz文件(例如ggplot2_3.3.5.tar.gz)。

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