RJAVA NosuchfileException从R运行JAR时

Question

我正在尝试使用RJAVA软件包从R运行可运行的JAR文件。这个罐子必须在外部文件夹中写入和读取一些文件，这些文件与jar文件本身相同的路径，例如：

mypath/myjar.jar
mypath/folder1
mypath/folder2
mypath/input_file1.txt
mypath/input_file2.txt

如果我通过在"我的路径"中打开控制台并以以下方式运行罐子，则该程序可以正常工作：

：

java -jar myjar.jar input_file1.txt input_file2.txt false

但是，当我尝试在r中运行此代码时，使用rjava时，代码在某个时候崩溃，因为它既找不到我的path/folder1或my path/path/folder2"。

jinit(".",force.init=TRUE) # this starts the JVM
.jaddClassPath("myjar.jar")
jobject <- .jnew("package_name/Main")  ## call the constructor
result_java <- rJava::.jcall(obj = jobject, returnSig = "V", method = "main", c("input_file1.txt","input_file2.txt","false"))

实际上，Java程序被称为，它可以实际找到也在我的Path中的输入文件，但是由于某种原因，当它试图用MyPath中的文件夹写入（例如Folder1和Folder2）时，它会崩溃错误：

Error executing task java.nio.file.NoSuchFileException: folder1/some_file.txt

我真的不知道发生了什么，花了几个小时。我在这里很明显吗？

Answer 1

当您使用Java运行代码时，您在mypath中，位置folder1和folder2可见。

也许您应该通过（作为参数）目录的位置，而不是在Java代码中访问folder1，而是应该访问显式路径。

result_java <- 
   rJava::.jcall(
     obj = jobject, 
     returnSig = "V", 
     method = "main",
       c( 
         "input_file1.txt",
         "input_file2.txt",
         "false",
         "full_path_to_your_mypath_location"))

然后，在main内，您可以简单地打开full_path_to_your_mypath_location/some_file.txt。当您启动R时，您可能不再使用代码内部目录。您也可以尝试更改dir

setwd(full_path_to_your_mypath_location)