基于另一个关联数组创建关联数组

Question

我做了一个关联数组，如下所示。为了提供一些细节，键引用特定文件，因为我将在更大的脚本上下文中使用此数组(其中包含文件的目录将是 getopts 参数(。

declare -A BAMREADS
echo "BAMREADS array is initialized"
BAMREADS[../data/file1.bam]=33285268
BAMREADS[../data/file2.bam]=28777698
BAMREADS[../data/file3.bam]=22388955
echo ${BAMREADS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMREADS[@]} # Output: ../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam

到目前为止，这个数组的行为似乎符合我的预期。现在，我想基于这个数组构建另一个关联数组。具体来说：我的第二个数组将与我的第一个数组具有相同的键，但我想将值除以一个名为 $MIN 的变量。

我不确定以下哪种策略最好，我似乎无法使这两种策略都起作用。

策略 1：复制数组并修改数组？

MIN=33285268
declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"
BAMFRACS=("${BAMREADS[@]}")
echo ${BAMFRACS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMFRACS[@]} # Output: 0 1 2

这不是我想要的钥匙。即使它有效，我也需要对所有值执行我提到的操作。

策略 2：在循环遍历第一个数组时构建第二个数组。

MIN=33285268
declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"
for i in $(ls $BAMFILES/*bam)
do
echo $i
echo ${BAMREADS[$i]}
BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]} 
done
echo ${BAMFRACS[@]}
echo ${!BAMFRACS[@]}

# When I run this, I get the following error which I am unsure how to solve:
../data/file1.bam
33285268
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file1.bam]: No such file or directory
../data/file2.bam
28777698
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file2.bam]: No such file or directory
../data/file3.bam
22388955

更新更新了策略2，其输出更加清晰。 谢谢

Answer 1

在两者中

declare -A BRAMFRACS

应该是

declare -A BAMFRACS

也就是说，名称中有一个额外的"R"，其中一个错误的原因是BAMFRACS是一个索引数组(默认值(，而不是关联数组。

在策略 2 中：

BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]} 

应该是

BAMFRACS[$i]=${BAMREADS[$i]

也就是说，=周围不允许有空格。BAMFRACS[$i]被视为命令，因为命令由空格分隔。

顺便一提

for i in $(ls $BAMFILES/*bam) 

可以写成：

for i in "$BAMFILES"/*bam

尝试：

MIN=33285268
declare -A BAMFRACS
for key in "${!BAMREADS[@]}"
do
val=${BAMREADS[$key]}
BAMFRACS[$key]=$((val/MIN))
done
echo ${BAMFRACS[@]}  
echo ${!BAMFRACS[@]} 

给：

1 0 0
../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam