R 包生成，"object 'xxx' not found"原因

Question

我正在尝试从包外部工作的代码构建 R 包。 我的第一次尝试是相当复杂的嵌套函数，最终使用 doMPI 和 foreach 进行并行处理。 也在 Ubuntu 16.04 上使用 RStudio 1.01.43。 我构建了软件包并且工作正常。 然后，当我尝试运行调用下一个的顶级函数时，它会抛出错误：

Error in { : task 6 failed - "object 'RunOys' not found" 

在调用顶级函数之前，我手动设置布尔变量 RunOys=TRUE，当它下降到为 ifelse 语句调用此变量的那个时，它会失败。 在我调用顶级函数之前，我检查了 globalenv(( 和

> RunOys
[1] TRUE

在foreach并行代码中，我有以下语句，该语句在编译成R包之前有效：

FinalCalcs <- function (...) {
results <- data.frame ( foreach::`%dopar%`(
foreach::`%:%`(foreach::foreach(j = 1:NumSim, .combine = acomb,
.options.mpi=opts1),
foreach::foreach (i = 1:PopSize, .combine=rbind,
.options.mpi=opts2,
.export = c(ls(globalenv())),
.packages = c("zoo", "msm", "FAdist", "qmra"))),
{

它应该将 globalenv(( 中的所有对象导出到每个从站。

我不明白为什么有些变量似乎被传递而不是其他变量。 我是否需要在调用它的函数的文件中将其显式指定为@param？

Answer 1

对于foreach，更好的方法是将所有需要的变量存在于调用foreach的同一环境中。所以基本上，我总是在函数中使用foreach，并将foreach中需要的所有变量传递给这个函数。

做foreach看不到它的调用函数一样。您无需导出任何内容。对于函数，请使用package::function(就像在包中一样，这样你就不需要@import包了(。