与qsub的作业链接

Question

我有一个python脚本，它对输入文件执行一些操作，然后使用qsub提交一个新作业。

一旦这个新提交的作业完成，我想再次运行python脚本。因此，基本上，这个python脚本的运行必须链接到上一个作业的运行，该作业是python脚本本身提交的。

用代码术语进行总结。我进入父目录并键入：

./python_script.py

python脚本的结构如下（在现实中要复杂得多）：

def Main():
    subdirectory = IdentifySubDirectory()
    os.chdir(subdirectory)
    EditInputFile()
    qsub jobscript.sh
    os.chdir(parentdirectory)

我如何使用我的python脚本和jobscript来实现这一点？

以前我一直在使用crontab并每x小时运行一次，但这是一种非常不令人满意的情况，因为每个模拟运行所需的时间不同，导致了大量的停滞时间。

感谢您的帮助

Answer 1

如果这是TORQUE，则可以使用作业依赖关系来获取所描述的行为。这里记录了作业依赖性提交，只需在dependent一词上查找即可。

Answer 2

重新提交作业脚本：

jobscript.bash:
#!/bin/bash
cd $PBS_O_WORKDIR
./pythonscript.py
qsub -N reiterateSim jobscript.bash