目标和工具
我目前尝试熟悉R包BTM和textplot，即如何创建通过textplot创建BTM双项主题模型(BTM 模型)的可读性和有意义的可视化。textplot::plot.BTM()是一种创建使用BTM::BTM()创建的模型的群集可视化的方法。BTM::BTM()的文档和textplot::plot.BTM()的文档都包含专用于绘图的代码示例。根据文档，textplot::plot.BTM()返回类ggplot的对象。
以前的尝试和观察
安装这些示例中提到的软件包(即concaveman、ggraph和igraph)后，我可以成功地复制这些示例图。另外，我自己的情节看起来像例子。
但是，当我从新的 R 会话开始并运行我的脚本(请参阅下面的最小代码)时，我的绘图突然看起来不同。聚类形状的颜色，尤其是边缘，不再是演示图中的浅色柔和色调，而是深色和明亮的色调，例如深棕色，与黑色标记产生低对比度(请参阅此屏幕截图)。除此之外，边缘变得非常厚，因此它们覆盖并超过了下面的簇形。这样，情节是不可读的，绝对看起来很破碎。很奇怪。
我注意到R输出类似*
Load required namespace: ggraph
Load required namespace: concaveman
当我运行textplot::plot.BTM()时，尽管有时由于未知原因只提到concaveman。调用class()表示返回值属于从ggplot继承的类ggraph。在我看来，如果需要，这些功能可以正确安装和使用这些软件包。所有相关软件包都会更新，即安装 0.3.1 和 0.1.2BTMtextplot以明确提及核心软件包版本。
*我得到这些德语和字面翻译。
我的问题
- 如何确保我的绘图始终按预期显示，即具有浅色柔和的阴影和适当大小的边缘？
- 为什么我的绘图看起来不同，即具有明亮的深色阴影和极厚的边缘？
- 关于可读性;)的额外问题：如何确保所有令牌都具有可读的字体大小？我注意到在我的和示例图中，低频率的标记非常小，因此难以阅读。
非常感谢您的帮助！
这是我关于stackoverflow的第一篇文章，所以如果我错过了提问的最佳实践，请告诉我。
最少的代码
library(BTM)
library(textplot)
library(udpipe)
data("brussels_reviews_anno", package = "udpipe")
brussel_reviews <- subset(brussels_reviews_anno, language == "nl")
brussel_reviews <- subset(brussel_reviews, xpos %in% c("NN", "NNP", "NNS"))
brussel_reviews <- brussel_reviews[, c("doc_id", "lemma")]
btm_model <- BTM(brussel_reviews, k = 5)
plot(btm_model, top_n = 15,
title = "Topic Clusters of Top 15 Biterms",
labels = c("1 - Too dark color masking terms",
"2 - Looks okish",
"3 - Too thick edges",
"4 - Too thick edges",
"5 - Too thick edges"))
我实际上在发布问题后不久就找到了问题 2 的答案，但也与BTM包的开发人员取得了联系以澄清问题 1，并希望用我自己的话与您分享。不过，我可能不会完全准确地解释每个细节，因此欢迎更正。
总结
-
如何正确？
在每个会话中附加
ggraph包(请参阅下面更正的最小代码)。 -
为什么错了？附上
ggraph后，使用ggraph添加的另一种方法绘制绘图。 -
如何确保令牌可读？我认为别无选择，因为我们不能改变某些代币很少与它们的邻居术语共存。尽管如此，仍然可以引入可读的最小显示尺寸。我会考虑一个较小的滑动窗口，以避免罕见的双项，例如
BTM::BTM(window = 5).
更正的最小代码
library(BTM)
library(ggraph)
library(textplot)
library(udpipe)
[...]
详
- 如何？要使
BTM绘图看起来符合预期，您不仅需要安装软件包concaveman、ggraph和igraph，但在每个会话中附加ggraph包。(当然，还需要BTM来生成BTM模型以进行可视化。 查看BTM和textplot的文档，令人惊讶的是，ggraph总是附加在任何示例代码中。不过，起初，我将列表理解为需要安装哪些软件包，不一定要附加，尤其是在看到软件包列表因示例而异之后：BTM::BTM()提到：
library(igraph)
library(BTM)
library(ggraph)
textplot::plot.BTM()提到：
library(textplot)
library(ggraph)
library(concaveman)
textplot::textplot_bitermclusters()，底层函数，提到：
library(igraph)
library(ggraph)
library(concaveman)
library(BTM)
- 为什么？使用我的最小代码，绘图看起来不同，因为未附加包
ggraph。附加ggraph不是由plot.BTM()正确生成打印对象所必需的，但要正确打印打印对象。更准确地说，通过 ggplot2：:p rint.ggplot()ggraph绘图，但通过ggraph对象的方法扩展内部泛型函数ggplot2::ggplot_build()，即ggplot_build.ggraph()。在那里，如何绘制的算法在调用ggplot_build.ggplot()之前会暂时改变，从而产生不同的、更愉快的外观。 - 确保令牌可读？在
textplot::plot.BTM()中，令牌大小似乎取决于令牌与其相邻令牌在主题集群中共存的频率。我希望可以选择设置有意义的最小显示大小，因为我认为包含我无法读取的令牌没有意义，特别是考虑到无论如何我都无法从令牌大小中推断出频率。要尝试的一件事是缩小双项内置的滑动窗口，例如BTM::BTM(window = 5).这样，我可能会避免太多罕见的代币组合，从而避免情节中的小代币。不过，我不确定。