"fatal error: sql.h" unixODBC 和 pyodbc 作为供应商应用程序依赖项

Question

我正在尝试将 unixODBC 添加为供应商应用程序依赖项，如下所述：https://github.com/cloudfoundry/python-buildpack/issues/34，但我仍然收到致命错误：

sql.h：没有这样的文件或目录。

我在下面创建了一个最小、可验证、完整的脚本，以方便读者重现我的问题：

mkdir new_app
cd new_app
cat <<EOF>requirements.txt
pyodbc==4.0.17
EOF
cat <<EOF>manifest.yml
applications:
- name: pyodbc-test
memory: 128M
EOF
cat <<EOF>.profile
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/app/vendor/unixodbc/lib
EOF
sudo docker run -it --rm -v ${PWD}:/app cloudfoundry/cflinuxfs2 bash -c 
"wget ftp://ftp.unixodbc.org/pub/unixODBC/unixODBC-2.3.4.tar.gz;  tar xzf unixODBC-2.3.4.tar.gz; cd unixODBC-2.3.4;  ./configure --prefix=/app/vendor/unixodbc; make; make install;"

其次：

sudo chown -R ${USER}:${USER} vendor/
pip3 download -r requirements.txt -d vendor/
cf push 

cf 推送输出：

...
-------> Buildpack version 1.5.15
!     Warning: Your application is missing a Procfile. This file tells Cloud Foundry how to run your application.
!     Learn more: https://docs.cloudfoundry.org/buildpacks/prod-server.html#procfile
-----> Installing python-2.7.13
Downloaded [file:///tmp/buildpack/dependencies/https___buildpacks.cloudfoundry.org_dependencies_python_python-2.7.13-linux-x64.tgz]
$ pip install -r requirements.txt
Collecting pyodbc==4.0.17 (from -r requirements.txt (line 1))
Installing collected packages: pyodbc
Running setup.py install for pyodbc: started
Running setup.py install for pyodbc: finished with status 'error'
Complete output from command /app/.heroku/python/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-sxxn23/pyodbc/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('rn', 'n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-lRnuMu-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile:
running build
running build_ext
building 'pyodbc' extension
creating build/temp.linux-x86_64-2.7
creating build/temp.linux-x86_64-2.7/src
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -DPYODBC_VERSION=4.0.17 -I/app/.heroku/python/include/python2.7 -c src/errors.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/errors.o -Wno-write-strings
cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++ [enabled by default]
In file included from src/errors.cpp:2:0:
src/pyodbc.h:56:17: fatal error: sql.h: No such file or directory
#include <sql.h>
^
compilation terminated.
----------------------------------------
running install
creating build
error: command 'gcc' failed with exit status 1
Command "/app/.heroku/python/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-sxxn23/pyodbc/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('rn', 'n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-lRnuMu-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-sxxn23/pyodbc/
Failed to compile droplet
Exit status 223
Staging failed: Exited with status 223
Destroying container
Successfully destroyed container

这里有一个类似的问题：pyodbc 安装在 IBM Bluemix 服务器上的错误，但是这个问题与这个问题不同，因为它非常通用，而这个问题是关于同一主题的，但与一组非常具体的构建步骤有关。

更新：

---

这是基于接受答案的更新脚本：

mkdir new_app
cd new_app
cat <<EOF>environment.yml
name: pyodbc-test
dependencies:
- pyodbc
EOF
cat <<EOF>manifest.yml
applications:
- name: pyodbc-test
memory: 128M
EOF
cf push 

Answer 1

src/pyodbc.h：56：17：致命错误：sql.h：没有这样的文件或目录 #include

您的设置通常看起来正常，但是当pip在暂存期间运行时，构建工具仍然无法找到库标头。 标头之所以存在，是因为您将它们包含在vendor/目录中，但它不知道它们在那里，因为 python 模块的构建脚本不会在该位置查找它们。

我不知道有什么方法可以让它在不修改构建包的情况下在非标准位置查找标头，因为您需要向pip发送其他参数。

有些人建议设置CPATH和/或C_INCLUDE_PATH环境变量，因为这些变量应该被gcc拾取，但在我的测试中，这些被忽略了。

最后，我认为你最好的选择是使用 Conda 安装 pyodbc。 以下是您的操作方法。

1. 将environment.yml添加到项目的根目录。
2. 在其中添加以下内容：

name: pyodbc-test
dependencies:
- pyodbc

3. 运行cf push.

构建包应在暂存期间运行，安装 miniconda，然后使用 conda 安装依赖项，特别是 pyodbc。

希望对您有所帮助！

Answer 2

根据@Daniel Mikusa的回答...

您需要向 pip 发送其他参数。

Pip支持--global-options传递这种东西。不幸的是，从这里选项传递给 setup.py。

setup.py 对全局变量有自己的选择，这build_ext......

Options for 'build_ext' command:
--build-lib (-b)     directory for compiled extension modules
--build-temp (-t)    directory for temporary files (build by-products)
--plat-name (-p)     platform name to cross-compile for, if supported
(default: linux-x86_64)
--inplace (-i)       ignore build-lib and put compiled extensions into the
source directory alongside your pure Python modules
--include-dirs (-I)  list of directories to search for header files
... 

Setup.py 需要build_ext --include-dirs <path to unixodbc/include>

据我所知，要给 setup.py 这些参数，每个参数都必须单独加上--global-option=.

我刚刚经历了同样的头痛，以下对我有用。

pip install pyodbc --global-option="build_ext" --global-option="--include-dirs" --global-option="<path to unixodbc/include>"