简介
我正在用inline-c
包装一个C数字库;一些函数可以通过回调传递到步骤例程,比如ODE的优化或时间集成。
特别是在本机C使用中,回调可以对连续数组进行操作,通过指针修改它们,并将它们返回到一些不透明(分布式)数据结构。
因此,这是一个可变的数据问题,我想在Haskell方面表示它:根据我的理解,在回调中,我们应该冻结数组,处理它,例如作为Data.Vector.Storable.Vector
或使用repa
,解冻结果,获取外部指针并将其传递回。
内部:newtype Vec = Vec (Ptr Vec) deriving Storable
和inline-c
上下文中的相关条目表示指向不透明C数据结构的指针类型,vecGetArray
/vecRestoreArray
分别产生/请求指向连续内存的相同指针和请求/产生Vec
。
问:
我注意到,虽然返回的Vector
是正确的,但当我使用生成的、修改过的Vec
("副作用")时,从该函数返回后,它没有被修改。GHC不会补偿它(懒惰?)。我该如何让它重新计算它?Haskell中有什么惯用的方法来处理整个FFI中的可变数据?
*已修复*
见答案
谢谢!
import qualified Data.Vector.Storable as V
import qualified Data.Vector.Storable.Mutable as VM
withVecGetVectorM ::
Vec ->
(V.Vector PetscScalar_ -> IO (V.Vector PetscScalar_)) ->
IO (V.Vector PetscScalar_)
withVecGetVectorM v f = do
p <- vecGetArrayPtr v
pf <- newForeignPtr_ p
vImm <- V.freeze (VM.unsafeFromForeignPtr0 pf len)
vImmOut <- f vImm
vMutOut <- V.thaw vImmOut
let (fpOut, _, _) = VM.unsafeToForeignPtr vMutOut
pOut = unsafeForeignPtrToPtr fpOut
vecRestoreArrayPtr v pOut
return vImmOut
where len = vecSize v
Vec.hs:
vecGetArrayPtr :: Vec -> IO (Ptr PetscScalar_)
vecGetArrayPtr v = chk1 (vecGetArrayPtr' v)
vecRestoreArrayPtr :: Vec -> Ptr PetscScalar_ -> IO ()
vecRestoreArrayPtr v ar = chk0 (vecRestoreArrayPtr' v ar)
InlineC.hs
-- PETSC_EXTERN PetscErrorCode VecGetArray(Vec,PetscScalar**);
vecGetArrayPtr' :: Vec -> IO (Ptr PetscScalar_, CInt)
vecGetArrayPtr' v = withPtr $ p -> vga v p where
vga v p = [C.exp|int{VecGetArray($(Vec v), $(PetscScalar** p))}|]
-- PETSC_EXTERN PetscErrorCode VecRestoreArray(Vec,PetscScalar**);
vecRestoreArrayPtr' :: Vec -> Ptr PetscScalar_ -> IO CInt
vecRestoreArrayPtr' v c = with c $ pc -> vra v pc
where
vra w pc = [C.exp|int{VecRestoreArray($(Vec w), $(PetscScalar** pc))}|]
此外,IIUC,该代码制作了载体的两个额外副本,一个在冷冻时,一个解冻时,但我怀疑这是低效的。有人能提出改进或简化的建议吗?
已修复:
我犯了一个小错误,该处理哪些指针;这是解决办法。这个函数和bug函数有相同的签名,这表明必须有一种类型化的方式来表示我们正在修改哪个指针。如果有人对此有任何建议,请随时联系。
vecRestoreVector :: Vec -> V.Vector PetscScalar_ -> IO ()
vecRestoreVector v w = do
p <- vecGetArrayPtr v
pf <- newForeignPtr_ p
V.copy (VM.unsafeFromForeignPtr0 pf len) w
vecRestoreArrayPtr v p
where
len = vecSize v