如何从Python上的.cel文件中提取数据表

Question

我有一个.cel文件从www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gdsbrowser中载出。需要从文件中提取数据数组。我从Bio.Affy Library进口Celfile：

with open('Myfile.CEL') as f:
    c = CelFile.read(f)
    print(c)

这不会显示任何数据集！关于如何使用Celfile的想法吗？谢谢。

Answer 1

read((方法带有记录对象(您的示例中的C(。该对象具有多个数组，例如强度，stdevs，npix等，您需要这些。

在这里您找到了一些示例：

https://biopython.org/dist/docs/api/bio.affy.celfile.record-class.html

有时help((函数可以为您提供足够的信息，如何使用类，功能等。