Python - 3D切片器以及从图像中检索灰色和白色数据



我必须做一个项目,在这个项目中,我必须分析一张图像,从该图像中获得数据(白质和灰质(,然后绘制该大脑图像的3个切片。

现在我已经在pycharm中安装了OpenCV、numpy和matplotlib。。我正在使用windows平台,你能请任何人帮我完成这个项目吗。

我使用切片器进行组织分类。这不是很准确。我建议你开始使用期望最大化(EM(,并为你的高斯定义一个3类组织。

如果你可以访问PMOD软件,它有一个非常好的工具来对大脑数据进行分类。

为了深入了解您的数据,您可以下载程序3D Slicer(https://download.slicer.org),那么您应该能够加载您的图像。由于它支持多种格式(DICOM、nrrd、nifti等等(,您应该能够加载它

然后,为了"分析"自己,您可以利用嵌入式python解释器并访问与卷对应的numpy数组。

请参阅https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Developers/Python_scripting#Accessing_Volume_data_as_numpy_array

它还包括一组广泛的模块来处理、转换、分割和注册您的图像。这里提供的教程应该很有帮助:https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Training

作为您在相关论坛上的问题:http://discourse.slicer.org/

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