R-在命令行中以编程方式创建的RScript调用



我有以下脚本:

rstest

text=$1
cmd="Rscript -e "a='$1'; print(a)""
echo $cmd
$cmd

这是我运行时获得的输出:

balter@spectre3:~$ bash rstest hello
Rscript -e "a='hello'; print(a)"
Error: unexpected end of input
Execution halted

但是,如果我直接运行回声命令,则运行良好:

balter@spectre3:~$ Rscript -e "a='hello'; print(a)"
[1] "hello"

我想了解为什么这是。我尝试了引用bash变量并添加 eval的各种组合。但这似乎不是问题。

编辑

我尝试了下面给出的答案,但是得到不同的结果!

balter@spectre3:~$ cat rstest
text=$1
cmd="Rscript -e "a=$1; print(a)""
echo $cmd
eval $cmd
balter@spectre3:~$ bash rstest
Rscript -e "a=; print(a)"
Error in cat("pointing to conda env:", env_name, "and lib location", lib,  :
  argument "env_name" is missing, with no default
Calls: startCondaEnv -> cat
Execution halted

下面的脚本对我有用。

text=$1
cmd="Rscript -e "a='$1'; print(a)""
echo $cmd
eval $cmd

删除eval给出了您发布的错误。

Rscript -e "a='Hello'; print(a)"
Error: unexpected end of input
Execution halted

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