如何根据读数数排除R中的患者?

Question

我正在努力解决过滤数据的特定方面。

我有一个表格，记录了研究过程中大约 8000 名患者的大约 300 个参数。我已经可以过滤那些没有基线读数的患者，但我正在努力排除某个变量读数数量较少的患者。

例如，我正在尝试运行一个简单的模型，该模型将胃肠道评分与一系列其他变量相关联。我需要确保的是，将零或一个读数SCOPAAUT_gastrointestinal的患者排除在外。有没有人处理过与此有关的事情？我可以索引患者数量，但从那里开始，我不确定在哪里进展。

model1 <- lmer(SCOPAAUT_gastrointestinal~Age_bl + GENDER + EDUCYRS + APPRDX_enrol +
(1 + Years_bl|PATNO), data = datasetfilteredDR)

Answer 1

如果没有可重复的数据，就很难衡量您到底需要什么。但是从帖子来看，您似乎只是想弄清楚如何在某个条件下过滤数据帧。这可以通过子集来完成。

假设您有一个类似这些行的数据帧：

set.seed(23)
df <- data.frame(
patient = c("A", "A", "B", "C", "A", "B", "A", "C", "A", "B"),
readings = c(sample(1:5, 10, replace = T)),
other_var = c(sample(10))
)
df
patient readings other_var
1        A        5         8
2        A        4         4
3        B        3         3
4        C        1         6
5        A        3         7
6        B        5         5
7        A        2         2
8        C        1         9
9        A        5         1
10       B        1        10

假设您想排除那些读数少于 3 的患者。然后，您可以在要筛选的变量上使用否定运算符!和子集df：

df_filtered <- df[!df$readings < 3, ]
df_filtered
patient readings other_var
1       A        5         8
2       A        4         4
3       B        3         3
5       A        3         7
6       B        5         5
9       A        5         1