在R中，我想列出目录中的文件，并捕获输出，但是R对系统进行了两次调用：system()和system2()。我很好奇有什么区别，如果有的话，更重要的是如何使用它们。我找到了一些页面，包括这里和这里，但我想在这里放一些例子，以及我在使用 system2() 时遇到的错误，包括：
SH： 1： LS/首页 ： 未找到
在研究之前，我的第一次尝试都是在system()完成的，因为我不知道system2()。为了可移植性，我决定在system2()重做我的方法(我正在开发 Linux 系统)。这让我发现了一些不同之处。
首先，system()列出文件并将输出保存在变量中的解决方案：
gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system(paste("ls", gseaDirectory, sep=" "), intern=T)
这会将一个字符串"/home"(我的主目录所在的位置)存储到变量 gseaDirectory 中。然后，我能够将命令ls、空格、sep=" "和我的目录变量gseaDirectory粘贴到 linux 命令中，以列出所选目录中的所有文件：
ls /home
然后，文件列表保存在变量"文件名"中，并添加 system() 参数intern=T。
这在 system2() 中不起作用，只返回错误：
SH： 1： LS/首页 ： 未找到
我们相同的方法略有改变，等效system2()命令是：
gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system2('ls', paste(gseaDirectory, sep=" "), stdout = TRUE)
system2 中的第一项是命令，然后是目标文件，后跟stdout=T告诉 R 我们将输出存储到变量中，否则命令的结果将被打印而不是保存。
希望这对某人有所帮助！