我正在尝试在 igraph 中进行网络分析,但鉴于列的数量不同,将我拥有的数据集转换为边缘列表(带权重(时遇到了一些问题。
数据集如下所示(当然要大得多(:首先是主操作员 ID(主运算符也可以是伙伴,反之亦然,因此 Id 在邻接中保持不变(挑战在于伙伴的数量各不相同(从 0 到 40(。
IdMain IdPartner1 IdPartner2 IdPartner3 IdPartner4 .....
1 4 3 2 NA
2 3 1 NA NA
3 1 4 7 6
4 9 6 3 NA
.
.
我的问题是如何将其转换为具有无向权重的边缘列表(仅表示交互(:
Id1 Id2 weight
1 2 2
1 3 2
1 4 1
2 3 1
3 4 2
. .
有没有人提示最好的方法是什么?提前非常感谢!
这是一个经典的重塑任务。为此,您可以使用reshape2
包。
text <- "IdMain IdPartner1 IdPartner2 IdPartner3 IdPartner4
1 4 3 2 NA
2 3 NA NA NA
3 1 4 7 6
4 9 NA NA NA"
data <- read.delim(text = text, sep = "")
library(reshape2)
data_melt <- reshape2::melt(data, id.vars = "IdMain")
edgelist <- data_melt[!is.na(data_melt$value), c("IdMain", "value")]
head(edgelist, 4)
# IdMain value
# 1 1 4
# 2 2 3
# 3 3 1
# 4 4 9