如何在不删除空值的情况下在 R 中创建相关矩阵?

Question

>im 尝试在 r 中使用相关矩阵 我的数据有一堆空值或不适用值 我目前的方法是将这些空值转换为 0 这有效，但它会导致矩阵不准确，因为某些具有相关性的列被 0 您知道修复NA值的任何解决方案吗？

这是我的代码：

mydata = read.csv("exoplanet.csv")
res2 <- cor(mydata[sapply(mydata, function(x) is.numeric(x))])
res2[is.na(res2)] <- 0
corrplot(res2, type = "upper", order = "hclust", 
tl.col = "black", tl.srt = 45)

这是我尝试过的解决方法：

mydata = read.csv("exoplanet.csv")
mydata = lapply(mydata, as.numeric)
mydata = as.matrix(as.numeric(unlist(mydata))) 
//the reason i do this is because otherwise i get a list to double error

现在，当我尝试使用此图时，出现此错误：

The matrix is not in [-1, 1]! or In as.dist.default(1 - corr) : non-square matrix

Answer 1

您需要删除只有 1 种值类型的列(不包括 NA(：

x = read.csv("./Downloads/Exoplanet extract new.csv")
is_num = sapply(x,is.numeric)
not_mono = sapply(x,function(i)length(unique(i[!is.na(i)])))>1

然后：

cor(x[,is_num & not_mono],use="p")

由于某些列之间缺少一些值，您仍然有 NA 单元格，但很可能这是您能做的最好的事情。