背景:我有7个样本的蛋白质组学数据(pvalue/log-score of fold change)，我想通过网络(interactome)分析来分析数据。
问题:我喜欢从数据中创建所有蛋白质的相互作用组，并将具有显著p值的蛋白质映射到该网络(与对照组相比)，之后，我喜欢创建子网;还喜欢将路径富集添加到子网中。
请求:请建议符合我要求的在线或独立工具(或算法)。
谢谢!
要创建网络图来表示蛋白质与蛋白质之间的相互作用，我建议您查看一下networkx库。您可以使用它传入一些节点(感兴趣的蛋白质)和边缘(相互作用)并生成一个图。我相信它也可以生成这些图的子网络
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