将gunzip输出重定向到python脚本



我想要gunzip一系列文件,然后将输出重定向到我的python脚本。python脚本获取一个参数作为输入。我写了下面的命令:

for i in $(ls test5/*/*gz); do gunzip -c $i | python script.py ; done

但是它给了我以下错误:

Traceback (most recent call last):
  File "./fqtofa.py", line 7, in <module>
    inFile = sys.argv[1]
IndexError: list index out of range

我想知道为什么它不能从gunzip输出中读取

sys.argv用于命令行参数。你没有传递这些,你是通过stdin输入的。所以你需要从sys.stdin中读取

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