这可能是R问题和算法问题的混合。问题是关于OPTICS的一般情况和"dbscan"包中光学器件的R实现（https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/dbscan.pdf）
我从使用DBSCAN转向OPTICS的主要原因是，我拥有的数据集具有可变密度的簇，并且它们的形状不规则。OPTICS生成可达性图，但对于我的用例来说，更有趣的部分是聚类的提取。原始论文中描述了一些自动聚类提取，这不仅仅是eps的一个切入点。（http://fogo.dbs.ifi.lmu.de/Publikationen/Papers/OPTICS.pdf)。
所以我的两部分qn：1） 有没有办法以这种方式使用R包进行自动提取？2） 是否有支持这一点的OPTICS实现（python，其他地方）？
1）是的！dbscan包具有提取具有可变密度的光学集群的功能。?dbscan::extractXi()
extractXi基于可达性图的陡峭度提取Ankerst等人（1999）中高级指定的聚类。xi参数的一种解释是，它通过相对簇密度的变化对簇进行分类。所使用的算法最初由ELKI框架提供，但包含一组修复。
请参阅https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/vignettes/dbscan.pdf有关方法和示例的详细描述，