r - Geom_violin + geom_error_bar

Question

我对 3 个对象有 500 个估计。我的目标是绘制一个小提琴图以了解估计的分布，但同时，我想可视化标准误差(以另一种方式评估)、平均值估计值和真实值。

这是我所拥有的：

object1 <- rnorm(500,mean=1,sd=0.1)
object2 <- rnorm(500,mean=2,sd=0.1)
object3 <- rnorm(500,mean=3,sd=0.1)
estimations <- data.frame(object1,object2,object3)
colnames(estimations) <- 1:3
SEframe <- data.frame()
SEframe <- rbind(SEframe,c(1,1,mean(object1),0.1))
SEframe <- rbind(SEframe,c(2,2,mean(object2),0.15))
SEframe <- rbind(SEframe,c(3,3,mean(object3),0.25))
colnames(SEframe) <- c("ID","True.value","Estimated.value","SE")
estMelted <- melt(estimations)
estMelted$variable <- as.factor(estMelted$variable)
p <- ggplot(estMelted, aes(x=variable, y=value)) + 
geom_violin()

现在我想在图表上有一条线表示真实值，一条误差线用于估计和 SE。

我该怎么做？

Answer 1

您始终可以为其他图层指定其他数据集。在这里，我们添加一个geom_errorbar层和一个geom_point层，两者都与data=SEframe.

p + 
geom_errorbar(data=SEframe, aes(x=ID, 
ymin=Estimated.value - SE, 
ymax=Estimated.value+SE), inherit.aes=F) + 
geom_point(data=SEframe, aes(x=ID, y=Estimated.value))

请注意inherit.aes=FALSE的用法。原因如下：默认情况下，geom_errorbar 将从ggplot()继承映射，但该映射使用名为value的列。即使geom_errorbar不需要它(因为它不需要y)，它仍然会被继承并导致问题。因此，我们指定 aes 不应该被继承。