我有一个以列表作为值的数据帧。
index=pd.MultiIndex.from_product([["file1", "file2", "file3"], ["a", "b"]])
index.names = ['file', 'name']
data = [
[[1,1],[0,0]],
[[],[]],
[[2,2,2],[7]],
[[],[]],
[[1],[4, 4]],
[[],[]],
]
df = pd.DataFrame(data, index=index, columns=['col1', 'col2'])
df
东风
col1 col2
file name
file1 a [1, 1] [0, 0]
b [] []
file2 a [2, 2, 2] [7]
b [] []
file3 a [1] [4, 4]
b [] []
我想按name
分组并在每行和其他行的串联之间运行柯尔莫哥罗夫-斯米尔诺夫测试 (scipy.stats.ks_2samp
(。名称a
的示例。{file1,a}
==[1,1]
.其他的串联{file2,a}
+{file3,a}
==[2,2,2]
+[1]
==[2,2,2,1]
.它们之间的 KStest 是stats.ks_2samp([1,1], [2,2,2,1])
==0.75
。 我怎样才能得到下面的预期结果(手动完成(?
col1 col2
file name
file1 a 0.75 1.0
b NaN NaN
file2 a 1.0 1.0
b NaN NaN
file3 a 0.6 0.66
b NaN NaN
如果这是一个太临时的问题,我很抱歉。
以下是我的尝试。我无法弄清楚从其他行中排除目标行的优雅程度。
df.groupby(['name']).apply(
lambda per_name_df: per_name_df.apply(
lambda per_column: per_column.apply(
lambda cell: stats.ks_2samp(cell, np.concatenate(per_column.to_numpy())) if cell else cell)))
...在单行和其他行的串联之间进行测试
由于您没有特别指定哪些行,因此我将为您提供一个示例来测试第一行和所有剩余行:
from scipy.stats import ks_2samp
def ks(a, b):
b = [el for li in b for el in li]
if a and b:
return ks_2samp(a, b)[0]
df.groupby(df.index.get_level_values('name')).col1.apply(lambda x: ks(x[0],x[1:].to_list()))
结果:
name
a 0.75
b NaN
Name: col1, dtype: float64
编辑问题的更新:
。在每行和其他行的串联之间进行测试
def ks_all(a):
a = a.to_list()
return [ks(a[i],a[:i]+a[i+1:]) for i in range(0,len(a))]
df.groupby(df.index.get_level_values('name')).transform(ks_all)
结果:
col1 col2
file name
file1 a 0.75 1.000000
b NaN NaN
file2 a 1.00 1.000000
b NaN NaN
file3 a 0.60 0.666667
b NaN NaN