如何并行运行MATLAB计算

Question

i具有MATLAB .M脚本，该脚本使用MATLAB的Neural Network Toolbox设置和训练神经网络（" NN"）。该脚本推出了一些GUI，显示了Trainig进度等。NN的培训通常需要很长时间。

我正在用64个处理器内核在计算机上进行这些实验。我想同时培训多个网络，而不必进行多个MATLAB会议。所以我想：

1. 开始培训神经网络
2. 修改脚本创建网络以创建不同的网络
3. 开始修改网络的培训
4. 修改脚本以创建另一个网络...
5. 重复步骤1-4几次

问题在于，当我运行脚本时，它会阻止MATLAB终端，因此直到脚本执行其最后一个命令，我才能做任何其他事情 - 这需要很长时间。如何并行运行所有这些计算？我确实有MATLAB并行工具箱。

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编辑：matlab错误??

更新：此问题似乎仅在R2012A上发生，看起来像R2012B上的修复。

当我尝试在EDRIC答案中推荐的命令序列时，有非常奇怪的错误。这是我的代码：

 >> job = batch(c, @nn, 1, {A(:, 1:end -1), A(:, end)});
 >> wait(job);
 >> r = fetchOutputs(job)
 Error using parallel.Job/fetchOutputs (line 677)
 An error occurred during execution of Task with ID 1.
 Caused by:
    Error using nntraintool (line 35)
    Java is not available.

这是nntraintool的第27-37行（MATLAB神经网络工具包），其中错误起源于：

if ~usejava('swing')
  if (nargin == 1) && strcmp(command,'check')
    result = false;
    result2 = false;
    return
  else
    disp('java used');
    error(message('nnet:Java:NotAvailable'));
  end
end 

因此，似乎问题是使用batch命令执行作业时GUI（因为不可用）无法使用。奇怪的是，nn函数不会以当前形式启动任何GUI。错误是由默认启动GUI的火车引起的，但在nn中，我已关闭了该Gie：

net.trainParam.showWindow = false;
net = train(net, X, y);

更有趣的是，如果正常启动相同的nn函数（>> nn(A(:, 1:end -1), A(:, end));），它永远不会进入第27行上nntraintool的语句的外部（我已经使用DEBUGGER检查了该语句）。因此，使用相同的函数，同一参数表达式 ~usejava('swing')在正常启动时评估 0，但使用 batch启动时为1。

您对此有何看法？看起来像丑陋的matlab或神经网络工具箱bug ：（（（（（

Answer 1

使用并行计算工具箱，您可以运行多达12个'本地工人'来执行脚本（要运行更多的是，您需要购买其他MATLAB分布式计算服务器许可证）。鉴于您的工作流程，最好的事情可能是使用批处理命令提交一系列非交互式作业。请注意，您将无法从工人那里看到任何GUI。您可能会执行这样的操作（使用R2012A 语法）：

c = parcluster('local'); % get the 'local' cluster object
job = batch(c, 'myNNscript'); % submit script for execution
% now edit 'myNNscript'
job2 = batch(c, 'myNNscript'); % submit script for execution
...
wait(job); load(job) % get the results

请注意，批处理命令会自动将脚本的副本附加到作业上，以便您在提交后可以自由更改它。