我按照 https://github.com/citiususc/SparkBWA 的链接安装 SparkBWA:
git clone https://github.com/citiususc/SparkBWA.git
cd SparkBWA
mvn package
在"运行SparkBWA"部分中,它说使用命令运行它:
spark_dir/bin/spark-submit --class com.github.sparkbwa.SparkBWA SparkBWA-0.2.jar -h
但我没有安装火花提交命令。
如何提交火花?
谢谢。
- 安装 Spark 依赖项(JRE 或 JDK 1.7 或 1.8,不支持较新的 Java 版本(。
- 从Spark下载页面下载支持的版本(看起来很漂亮 旧,因此您可能必须使用 1.x 分支(。对于简单的测试,请使用带有捆绑Hadoop库的预构建变体。
- 解压缩内容并使用新创建的目录中
bin/spark-submit
命令。