R Mysql帮助需要从不同表中的变量进行计算

Question

我（非常！）是R和mysql的新手，几天来我一直在努力研究这个问题。所以我真的很感激任何帮助。

我需要用两个不同的表中的两个变量来完成一个数学表达式。从本质上讲，我试图弄清楚受试者在接受服务时的年龄（出生日期在一张表中）（服务日期在另一张表）。我有一个识别变量，它在两者中都是相同的。

我尝试过合并这些：

age<-merge("tbl1", "tbl2", by=c("patient_id") all= TRUE)

返回：

Error in fix.by(by.x, x) : 'by' must specify a uniquely valid column

我尝试过子设置，只保留感兴趣的变量，但不起作用，因为我认为子设置只适用于数字而不适用于字符。。正确的

再次感谢您的帮助。提前感谢

Answer 1

由于您是data.base的新手，我认为您应该在这里使用dplyr。它是许多数据库提供者的抽象层。因此，您将不必处理数据库问题。在这里，我向您展示了一个简单的示例：

1. 我阅读了MYSQL中的表格
2. 合并表，假设具有唯一的共享变量

代码：

library(dplyr)
library(RMySQL)
## create a connection
SDB <- src_mysql(host = "localhost", user = "foo", dbname = "bar", password = getPassword())
# reading tables
tbl1 <- tbl(SDB, "TABLE1_NAME")
tbl2 <- tbl(SDB, "TABLE2_NAME")
## merge : this step can be done using dplyr also 
age <- merge(tbl1, tbl2, all= TRUE)